對新發地毒株進行全基因組測序
京新冠病毒來自歐洲
【中新社北京十九日電】據中央紀委國家監委網站消息,中國疾病預防控制中心病毒病預防控制所專家近日三進新發地農產品批發市場開展病毒溯源工作。專家表示,從基因組流行病學的初步研究結果看,新發地檢出的新冠病毒從歐洲來,但與歐洲當下流行病毒有差別,毒株更接近於歐洲老病毒。
料非源於野生動物
六月十一日,北京在連續五十七天無新增本地確診病例後,再次出現本地病例。六月十四日、十五日、十七日,病毒病所專家先後三次進入新發地農產品批發市場。
第一次,病毒病所專家一共採了二百多份樣本,包括一整條三文魚的口腔拭子以及旁邊的水溝,其中檢出了不少新冠病毒核酸陽性樣本。第二次,他們在其他區域又採集的二百多份樣本中又有不少呈陽性。第三次,專家專門對市場上水、魚養殖保存水、水渠、地下水等水體系統進行了科學採集和檢測,同時還採集了空氣樣本以確定氣溶膠傳播風險,目前樣本正在檢測中。
對此,病毒病所所長助理、中國國家流感中心副主任劉軍解釋說,在病毒溯源工作中,對環境樣本的採樣檢測非常關鍵。不同的陽性樣本,指向的結論是不一樣的。他進一步解釋說,如果在沒有開封的凍品裡發現陽性樣本,這就進一步證實病毒通過冷鏈運輸到市場造成傳播的可能性;而如果凍品是開封之後的,這就表明這些凍品可能此前已經被人接觸過。
作為病毒病所赴武漢開展病毒溯源工作的溯源組組長,劉軍此前先後二十次進入武漢華南海鮮市場,此次又三次進入新發地農產品批發市場。
劉軍表示,海鮮市場的濕冷封閉,有利於病毒的存活與擴散,這有助於解釋為甚麼短時間內會在這裡出現大量病例。
然而,這並不意味着海鮮市場本身就是病毒的源頭。劉軍認為,新發地的病毒,有可能是被污染的海產品或肉食品通過冷鏈運輸到市場造成傳播,也有可能是進入市場的感染者造成了傳播。“不同的可能性都有,但這次疫情來源於野生動物的可能性很小。”
比歐洲流行病毒老
確定病毒流行時間的早晚,目前主要採取的是基因組流行病學的方法。“首先對病毒的全基因組進行測序,測序後運用生物信息學的分析方法,把不同的病毒放在一起,看哪個病毒突變的更多,變化更多的一般是進化更新後的病毒,突變少的更接近原始的病毒,它流行的時間也就更早,年齡也就更老。”劉軍介紹說。
“從基因組流行病學的初步研究結果看,這個病毒是從歐洲來的,但是它跟歐洲當下流行的病毒又有一定差別,它比現在歐洲流行的病毒要老。”病毒病所所長助理張勇表示,新冠病毒是如何進入新發地存在多種可能性。
疑潛伏在冷凍食品
他舉例道:“比如病毒潛伏在進口的冷凍食品當中,在從境外到境內的整個存儲、運輸期間,病毒由於被冷凍沒有發生進化,所以它不會發生變異;也有可能病毒是在新發地農產品批發市場等陰暗潮濕的環境裡潛伏下來,沒有被消毒、滅菌,在一定時間內突然暴露感染人,導致進化速度變慢,最終我們看到的就是這些毒株更接近於歐洲老病毒。”